Le cours de ce gastropode, sans coquille et sans branchie, est transparent et laisse apercevoir ses organes. Il peut toutefois être plus facilement repéré grâce aux couleurs vives, plutôt rougeâtres, présentes sur sont corps de ses organes. Le Clione limacina possède un postérieur pointu et une paire de nageoire en forme d'aile qu'il utilise pour se déplacer. Sa tête comprend deux paires de tentacules et est séparée du corps par une section ressemblant à un cou. Ses yeux sont localisés sur la paire de tentacules postérieure.